Pasó más de un mes desde que un grupo de indígenas del Territorio Indígena y Parque Nacional Isiboro Sécure (TIPNIS) iniciaran una marcha reivindicativa de 500 kilómetros que pretendía llegar hasta la Sede del Gobierno en La Paz para mostrar su rechazo a la construcción prevista de una carretera dentro de sus tierras. Durante varias jornadas la marcha había sido bloqueada por un grupo de colonizadores afectos al gobierno que habían cortado la carretera a la altura de Yucumo insistiendo en que los manifestantes debían detenerse y reanudar el diálogo con el gobierno de Evo Morales.

La policía reforzó igualmente dicho bloqueo explicando que pretendía así evitar cualquier choque entre los manifestantes y aquellos que les impedían el paso por la carretera. El mismo bloqueo también evitó que distintos suministros como alimentos, agua y medicinas donados desde las ciudades por millares de residentes llegaran a los manifestantes. La escalada de tensión entre ambas partes siguió su curso y se sentía en el ambiente la idea de que la intervención de los cuerpos de seguridad era inminente.

El 25 de setiembre, poco después de las 5 pm, hora local, en el momento en el que los manifestantes se estaban alimentando, se informó de que unos 500 agentes de policía uniformados empezaron a utilizar gases lacrimógenos para dispersar a los manifestantes y acorralarlos mediante omnibuses. La Fundación Tierra, desde el blog que mantenía, informó en directo de las primeras acciones que eran reportadas por su equipo desplegado en el lugar de los hechos.

17:18 GASIFICACIÓN. En este momento comenzó la gasificación policial a los indígenas en el campamento en el que se encuentran desde ayer.

17:25 RUMBO A LA PAZ. Se informa que en este momento la policía obliga a subir a las mujeres y niños indígenas en camionetas rumbo hacia Yucumo.

17:28 DESESPERACIÓN. En medio de la desesperación los niños lloran y las madres buscan no separarse de sus hijos mientras los efectivos policiales antimotines ingresan en el campamento indígena para desalojará a los marchistas y obligarlos a subir a camionetas que llegan desde San Borja.

[…]

17:49 ESTAMOS EN EL LUGAR. Hacemos todo lo posible para actualizar con toda la información posible pero como comprenederán no es una tarea facil y las comunicaciones son intermitentes.

Poco después que se iniciara la represión policial los medios de comunicación empezaron a informar desde el lugar aunque se supo de casos en los que la policía confiscó cámaras y teléfonos móviles de periodistas. Las distintas cifras de bajas que se aportan son contradictorias pero el canal de televisión Red Uno anunció la muerte de un bebé de tres meses de edad al parecer debido a los gases lacrimógenos empleados por la policía. La cadena Erbol indicó que al menos 45 personas eran atendidas en los hospitales de la zona y que el director del Hospital San Borja, Javier Jiménez, afirmaba que la policía había esposado a los médicos para evitar que tratasen a los indígenas que pertenecían a la protesta.

El blog TIPNIS Resiste recoge un testimonio personal de la representante indígena Esther Argollo que se encontraba presente cuando ocurrió la intervención policial. Ella cuenta lo siguiente:

Había una mujer que estaba con tres bebés, llorando en el camino y estaba entregando sus pequeños y a mí me dijo por favor mi bebé, mi bebé y yo le tuve que socorrer a un niño de tres años que estaba llorando y que rostro estaba lastimado de repente por una caída que ha tenido. Escapamos al monte porque los policías estaban tirando gases por todos lados, no han respetado a nadie, han rodeado el campamento, han tirado las cosas, han agredido a las personas, hay gente que ha sido golpeada.

… Había muchos niños perdidos, las mamás estaban buscando a sus hijos, no se sabe cuántas personas están todavía en el monte porque han corrido, estaban de miedo. Han corrido peladitos, sin nada. […] Todos están dolidos hay mamás que han perdido a sus bebés no se sabe dónde están, hay niños desaparecidos, está oscuro, no se sabe más de la gente, están perdidos, regados por todos lados.